Настройки программы позволяют задать отслеживаемые события, определить тип наблюдения за подпапками, настроить оповещение пользователя, задать настройки электронной почты и FTP, задать действия программы и выбрать варианты запуска программы.

Мониторинг:
"Следить за подпапками" - отслеживать изменения во вложенных папках, иначе будет вестись наблюдение только в указанной папке.
"Следить за папками как за файлами" - отслеживать изменения из раздела "Фиксировать события" применительно ко вложенным папкам, иначе наблюдение ведется только за файлам.
"Скорость опроса" - время в секундах указывающее как часто программа проверяет изменения в указанной папке.
"Фиксировать события" - можно указать оповещение о каких событиях производится программой. Событие "Изменение" также срабатывает при обращении к файлу, проверке его свойств и т.п., например антивирусной программой, чтобы исключить множественные оповещения об этом событии данную опцию лучше отключить.
"Исключения" - можно задать типы файлов (расширение с точкой) через пробел, которые будут игнорироваться при наблюдении за папкой.
"Использовать этот путь для мониторинга:"- Для мониторинга будет использоваться введенный путь вместо выбранного с помощью кнопки "Папка". Здесь можно вручную ввести путь к папке для мониторинга, например если необходимо установить наблюдение за скрытой сетевой папкой, которую через стандартный диалог выбора папки указать невозможно.

Оповещение:
"Только лог (не показывать сообщения)" - отключает оповещение пользователя о происходящих в папке изменениях, лог все равно ведется.
"Показывать сообщение"- устанавливает время в секундах, в течение которого будет отображаться всплывающее сообщение.
"Проигрывать звук"- включает или отключает воспроизведение звука при оповещении.
"Свой звук" - можно выбрать свой звук для оповещения. Файл должен быть в формате wav.
"Рассылать уведомления по сети" - включает или отключает оповещение пользователей по сети с помощью стандартных средств Windows (msg или net send на выбор).
По умолчанию включено оповещение с помощью MSG. В Windows XP SP3, Windows Vista, Windows 7 для корректной работы этой функции на компьютере получателя должен быть включен вызов удаленных процедур (AllowRemoteRPC), а на компьютере отправителя в Диспетчере учетных данных должны быть введены данные пользователя (имя и пароль), которому отправляется сообщение. Поддержка функции зависит от типа выпуска операционной системы (в Home точно не работает)
Можно включить использование NET SEND, но тогда в Windows Vista, Windows 7 оповещение работать не будет! Также на компьютерах поддерживающих эту функцию должна быть запущена Служба сообщений.

Действия:
"Запуск программы или пакетного файла" - позволяет установить запуск программы или пакетного файла при обнаружении изменений в наблюдаемой папке.
"Отправка отчетов по e-mail" - включает или отключает отправку программой отчетов и файлов с помощью электронной почты. Требуется настройка.
"Загрузка файлов на FTP" - включает или отключает загрузку программой файлов на FTP сервер. Требуется настройка.
"Копировать файлы в папку" - автоматически копирует новые файлы из наблюдаемой папки в директорию заданную пользователем. Можно вручную ввести путь к скрытой сетевой папке.
Задать для копирования вложенную папку по отношению к папке, в которой ведется мониторинг, при включенном наблюдении за подпапками - нельзя! Например: если ведется мониторинг всего диска C:\ с включенным наблюдением за подпапками, то установить для копирования файлов любую папку на данном диске будет невозможно.
"Перезаписывать существующие" - задает поведение программы в случае если в папке уже имеются файлы идентичные копируемым.
"Копировать только файлы (расширения файлов с точкой через пробел):" - можно задать фильтр для отбора копируемых файлов.

Программа:
"Подтверждение при закрытии" - включает или отключает диалоговое окно с подтверждением выхода из программы. Предназначено для исключения случайного закрытия программы.
"Стартовать вместе с Windows" - автозагрузка программы при запуске операционной системы.
"Автоматический запуск мониторинга" - автоматический запуск мониторинга с последними настройками при запуске программы. В некоторых случаях, при мониторинге сетевых ресурсов требующих авторизации с учетными данными, при запуске Windows программа не может получить доступ к указанной папке, чтобы это исправить необходимо просто открыть эту папку из Windows любым файловым менеджером.
"Убирать в трей при старте" - при запуске программа сразу минимизируется в область уведомлений без отображения интерфейса пользователю.
"Использовать анимированную иконку" - включает или отключает использование анимированной иконки.
"Проверять наличие обновлений при запуске" - программа будет автоматически проверять наличие новых версий на сайте.
"Если не отображаются всплывающие сообщения в трее" - на некоторых системах с Windows XP, Vista могут не отображаться всплывающие подсказки в трее. В этом случае воспользуйтесь этой кнопкой и программа внесет в реестр необходимые изменения чтобы исправить проблему.