Эта программа предназначена для новой серии жёстких дисков Western Digital (WD15EARS/WD20EARS и т. п. ) и им подобными с т. н. "длинными секторами", т. к. в связи с новым внутренним форматом при форматировании такого диска в среде ОС WindowsXP, Linux etc. происходит "промах" в реальной внутренней разметке диска и её внешней трансляцией непосредственно на контроллер материнской платы, в результате диск постоянно должен "переводить" свой формат в формат материнской платы при чтении с диска и из формата материнской платы в свой при записи (это упрощённое описание, более подробно читайте на сайте WD), при этом теряется время и, соответственно, скорость на операциях ввода/вывода. Например, на диске WD15EARS при предварительном форматировании в Linux или WindowsXP, без выравнивания разделов с помощью этой программы скорость на записи 15-30 Мб/сек., в то время как после применения этой утилиты или при форматировании из среды Windows 7 (которая по умолчанию поддерживает работу с "длинными" секторами) она составляет нормальные 50-70 Мб/сек. Поэтому для дисков этой серии настоятельно рекомендуется либо форматировать диски в среде windows 7, либо применять данную утилиту сразу после форматирования в других ОС. Отсюда следует, что для старых ОС эта утилита с новыми дисками вышеуказанных серий - насущная необходимость, для старых дисков без поддержки "длинных секторов" - нафиг ненужная трата времени, т. к. всё равно никакого выравнивания произойти не может по причине отсутствия "железной" составляющей для этого, для виртуальных машин - вообще полная дурость

Спасибо за пояснение