Антиспам Marisuite использует нескольких передовых методов фильтрации спама. Ядро спам фильтра основано на статистическом анализе почтовых сообщений - метод Байеса. По сравнению с другими Байесовскими фильтрами Антиспам Marisuite принимает во внимание значительно большее число статистических параметров писем. Также в антиспам Marisuite используются оригинальные вычислительные методы, которые позволяют проводить расчеты с большей точностью.
Для уменьшения вероятности ложных срабатываний используются методы, основанные на теории социальных сетей.